中国水科院拥有一支院士、领军人才、学科带头人和学术骨干组成的创新型科技人才队伍以及一批高水平团队，现有在职职工1266人。硕士以上学历1037人，其中博士639人。副高级以上职称926人，其中正高级职称520人。我院先后产生了15位院士，现有中国科学院院士1人、中国工程院院士3人。5位专家出任国际组织主席、1位专家担任副主席。百千万人才工程国家级人选7人、国家高层次人才特殊支持计划专家13人、重点领域创新团队首席专家1人、国家有突出贡献中青年专家3人、国家杰出青年科学基金4人、国家优秀青年科学基金5人、中国青年科技奖4人、全国优秀科技工作者3人等。