我院与国际水利行业中著名的科研单位与咨询公司有着广泛的合作关系，签定长期合作协议12项。每年接待外宾来访200人次，每年派出访问约100人次。同国外合作的研究项目，涉及防洪、泥沙、水质、大坝结构、岩土工程、水力机械、自动化、灌溉与排水，共数十项，其中利用我院先进实验设备，承担国外委托试验研究20余项。

积极开展国际咨询和工程投标工作，承担了马来西亚水电站设计、孟加拉防洪规划、孟加拉和越南橡胶坝建设、伊朗实验室规划等7项国外项目，并向东南亚周边国家出口水利水电技术装备。

在亚洲开发银行、世界银行、联合国、欧共体及外国政府对华的赠款、贷款项目中，中国水科院的专家是项目专家组的重要成员，执行了：华北水资源管理、海南北部水资源规划、新疆北部地区水资源可持续开发总体规划、黄淮海平原水土资源规划，支持黄河三角洲可持续发展和中国水行业发展战略研究等共13个项目。

中国水科院是4个国际组织中国委员会秘书处的常设机构，包括国际大坝委员会、国际灌排协会、国际水资源协会和国际水利学研究协会。我院先后参与组织和承办了20余次国际会议，还将参与承办2000年第20届国际大坝会议和2001年第29届国际水利学大会。

公派进修半年以上的110名人员中回国工作的占2/3以上，担任了业务骨干、学科带头人及院所领导。我院培养了一批复合型人才，形成一支老中青专家组成的科技外事队伍。