中国水科院是水利部最早开展国际科技交流与合作的单位之一，也是水利系统对外科技合作与交流的重要窗口。自八十年代后期以来，我院的国际合作从单一的外事交流进入了多层次和较大范围的合作阶段，包括合作研究、人员交流、联合投标、设计咨询、科技产品进出口、执行国际财团在华项目、承办国际学术会议、举办专业培训班等。国际合作的全面开展扩大了对外交流，促进了我院科研水平的体高，培养了科技骨干人才，提高了我院在国际同行中的信誉与知名度，创造了较大的经济效益。

    近年来，我院与英国、澳大利亚、日本等国开展了10余项有关水资源、河流治理、水环境、水土保持和遥感应用等方面的双边研究；利用世行、亚行、UNDP、UNEP、及欧共体等多渠道资金来源，与美国、瑞典、荷兰、加拿大、葡萄牙、瑞士、法国等国家的科研单位和咨询公司开展了水土资源规划与管理、防洪、水库调度、灌溉与排水以及水电资源开发等领域的合作；同时，我院利用自身的科技优势，承担了如日本、法国、德国等有关水利水电公司的委托项目，以及马来西亚、孟加拉和伊朗等发展中国家的水利科技咨询和援助项目。
我院在开拓国际市场、进行技术输出方面取得了很大成绩。1993年获科技产品对外经营权。十年来，承担了多项国外多项水利水电工程项目如马其顿和埃塞阿比亚水电站计算机监控系统、马来西亚里瓦古水电站设计、孟加拉防洪规划、越南和孟加拉橡胶坝建设、伊朗实验室规划、以及技术设备和材料的出口项目如大坝和水流观测仪器、核子秤和土工织物等，增强了我院在相关行业国际市场中的竞争能力。

    在国际交流方面，目前我院与近百家国际科研机构和大学保持着友好关系。每年有近百人次的对外交流。水科院的专家学者通过参加各种国际学术交流活动，活跃在国际学术舞台，同时还多次作为中国政府派遣专家代表，参加联合国召开的各种水问题会议。我院受上级部门和国际组织在华机构的委派，举办了如坝工技术、防洪技术等方面的国际培训班，加强了我院科技人员与各国水利同行的交流。

    我院是国际大坝委员会、国际灌排委员会、国际水利工程与研究协会、国际水资源协会及世界水伙伴组织五个国际学术组织中国委员会秘书处的挂靠单位。联合国科教文组织和水利部合作建立的国际泥沙研究培训中心设在我院。近年来，水科院主办和承办了多次不同专业的国际学术研讨会，承办了2000年的国际大坝委员会等68届年会暨第20届大会、2001年的第29届国际水科学大会，同时还将承办2005年的国际灌排大会。“泥沙研究”英文期刊编辑部在设在我院。

    水科院的国际合作正朝着多种形势、多种渠道、与世界各国同行在相关领域的广泛与深入合作的方向发展，同时为中国水利登上国际舞台起到积极的推进作用。